太魯閣馬拉松2017園區東部由海平面到500公尺以下地區，屬於亞熱太魯閣馬拉松2017帶夏季濕潤炎熱氣候區；南、北、西側位於海拔3,000公尺以上之高山地區，太魯閣馬拉花蓮溯溪松2017屬於高山寒帶氣候區；其餘在海拔1,000公花蓮住宿尺至3,000公尺山區，太魯閣馬拉松2017為山地亞熱帶濕潤炎熱氣候區。溯立霧溪而上，年平均氣溫由海拔100公尺處的23℃逐步遞減，至海拔3,000公尺的合歡山一帶，年均溫為7℃。到南湖大山及奇萊山一帶3,500公尺以上之高山地區花蓮住宿，年均溫則降為4℃，其中冬季12至2月間月均溫都在0℃以下，最低溫更會低至-10℃以下。國家公園範圍內年雨量幾乎都在2,000mm以上，無明顯旱季，夏季易受颱風影響，2,500公尺以上山區，冬季已有降雪。全區南、北地勢均高，中央地帶因位於歐亞大陸板塊和菲律賓板塊的碰撞交界以及太平洋西岸亞熱帶颱風豪雨區，產生複雜的地質現象。持續進行的極速造山運動，以及立霧溪的極速下切作用，旅遊花蓮形成奇特之高山、峽谷地形。太魯閣狹窄呈U字型的大理岩峽谷，深度超過1,000公尺，大理岩岩層厚度達千七星潭渡假飯店餘公尺以上，分布範圍廣達十餘公里。